Protein–RNA interactions for Protein: Q92826

HOXB13, Homeobox protein Hox-B13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB13Q92826 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HOXB13Q92826 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms