Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PHF3Q92576 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms