Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBXN4Q92575 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBXN4Q92575 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms