Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CSRNP3Q8WYN3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CSRNP3Q8WYN3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CSRNP3Q8WYN3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CSRNP3Q8WYN3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.3 ms