Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATRIPQ8WXE1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms