Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV41

SNX33, Sorting nexin-33, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX33Q8WV41 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNX33Q8WV41 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNX33Q8WV41 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms