Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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FAT3Q8TDW7 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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FAT3Q8TDW7 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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FAT3Q8TDW7 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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FAT3Q8TDW7 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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FAT3Q8TDW7 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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FAT3Q8TDW7 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
FAT3Q8TDW7 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
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