Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR3

SPTSSB, Serine palmitoyltransferase small subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSBQ8NFR3 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 DLEC1-201ENST00000308059 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 SFMBT2-201ENST00000361972 7922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 STRN-201ENST00000263918 8168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SPTSSBQ8NFR3 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms