Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC112Q8NEF3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC112Q8NEF3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms