Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
LINC00612Q8N6U2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms