Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PROM2Q8N271 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms