Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ96

CMTM1, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1Q8IZ96 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CMTM1Q8IZ96 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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