Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPAP2Q8IXW5 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms