Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms