Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
XIRP1Q702N8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
XIRP1Q702N8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms