Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FAM47EQ6ZV65 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FAM47EQ6ZV65 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms