Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CFAP47Q6ZTR5 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms