Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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C9orf47Q6ZRZ4 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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C9orf47Q6ZRZ4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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C9orf47Q6ZRZ4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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C9orf47Q6ZRZ4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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C9orf47Q6ZRZ4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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C9orf47Q6ZRZ4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
C9orf47Q6ZRZ4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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