Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms