Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC4A10Q6U841 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms