Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWW1

C1QL3, Complement C1q-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL3Q5VWW1 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
C1QL3Q5VWW1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1QL3Q5VWW1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1QL3Q5VWW1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1QL3Q5VWW1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1QL3Q5VWW1 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1QL3Q5VWW1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1QL3Q5VWW1 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1QL3Q5VWW1 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1QL3Q5VWW1 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
C1QL3Q5VWW1 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1QL3Q5VWW1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1QL3Q5VWW1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1QL3Q5VWW1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1QL3Q5VWW1 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
C1QL3Q5VWW1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1QL3Q5VWW1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1QL3Q5VWW1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1QL3Q5VWW1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1QL3Q5VWW1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1QL3Q5VWW1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1QL3Q5VWW1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1QL3Q5VWW1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1QL3Q5VWW1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1QL3Q5VWW1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1QL3Q5VWW1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1QL3Q5VWW1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1QL3Q5VWW1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1QL3Q5VWW1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1QL3Q5VWW1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1QL3Q5VWW1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C1QL3Q5VWW1 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QL3Q5VWW1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QL3Q5VWW1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QL3Q5VWW1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QL3Q5VWW1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QL3Q5VWW1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QL3Q5VWW1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QL3Q5VWW1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QL3Q5VWW1 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QL3Q5VWW1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QL3Q5VWW1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QL3Q5VWW1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QL3Q5VWW1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QL3Q5VWW1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QL3Q5VWW1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C1QL3Q5VWW1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms