Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVS0

C1orf140, Putative uncharacterized protein C1orf140, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf140Q5VVS0 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C1orf140Q5VVS0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1orf140Q5VVS0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms