Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
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C10orf55Q5SWW7 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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C10orf55Q5SWW7 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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C10orf55Q5SWW7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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C10orf55Q5SWW7 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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C10orf55Q5SWW7 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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C10orf55Q5SWW7 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
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C10orf55Q5SWW7 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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C10orf55Q5SWW7 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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C10orf55Q5SWW7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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C10orf55Q5SWW7 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
C10orf55Q5SWW7 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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