Protein–RNA interactions for Protein: Q5SR53

PIK3CD-AS1, Putative uncharacterized protein PIK3CD-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CD-AS1Q5SR53 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PIK3CD-AS1Q5SR53 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms