Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC93Q567U6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms