Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SLC39A12Q504Y0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC39A12Q504Y0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms