Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC38Q502W7 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms