Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTXN3Q4LDR2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CTXN3Q4LDR2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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