Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

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Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SPHKAPQ2M3C7 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
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