Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SKIDA1Q1XH10 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SKIDA1Q1XH10 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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