Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Q1T7F1 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Q1T7F1 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Q1T7F1 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Q1T7F1 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Q1T7F1 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Q1T7F1 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Q1T7F1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Q1T7F1 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Q1T7F1 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Q1T7F1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Q1T7F1 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Q1T7F1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Q1T7F1 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Q1T7F1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Q1T7F1 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Q1T7F1 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Q1T7F1 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Q1T7F1 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Q1T7F1 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Q1T7F1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Q1T7F1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Q1T7F1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Q1T7F1 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Q1T7F1 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Q1T7F1 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Q1T7F1 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Q1T7F1 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Q1T7F1 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Q1T7F1 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Q1T7F1 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Q1T7F1 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Q1T7F1 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Q1T7F1 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Q1T7F1 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Q1T7F1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Q1T7F1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Q1T7F1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Q1T7F1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Q1T7F1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Q1T7F1 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Q1T7F1 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Q1T7F1 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Q1T7F1 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Q1T7F1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Q1T7F1 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Q1T7F1 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Q1T7F1 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Q1T7F1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Q1T7F1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Q1T7F1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Q1T7F1 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Q1T7F1 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Q1T7F1 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Q1T7F1 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Q1T7F1 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Q1T7F1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Q1T7F1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Q1T7F1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Q1T7F1 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Q1T7F1 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Q1T7F1 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Q1T7F1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Q1T7F1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Q1T7F1 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Q1T7F1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Q1T7F1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Q1T7F1 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Q1T7F1 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Q1T7F1 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Q1T7F1 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Q1T7F1 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Q1T7F1 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Q1T7F1 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Q1T7F1 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Q1T7F1 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Q1T7F1 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Q1T7F1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Q1T7F1 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Q1T7F1 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Q1T7F1 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Q1T7F1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Q1T7F1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Q1T7F1 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Q1T7F1 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Q1T7F1 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Q1T7F1 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Q1T7F1 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Q1T7F1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Q1T7F1 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Q1T7F1 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms