Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CSPP1Q1MSJ5 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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