Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CLPPQ16740 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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