Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTF1Q16619 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms