Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ECM1Q16610 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
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ECM1Q16610 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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ECM1Q16610 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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ECM1Q16610 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
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ECM1Q16610 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ECM1Q16610 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
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