Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SLC18A3Q16572 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SLC18A3Q16572 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
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