Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCSK7Q16549 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms