Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDB1Q16531 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDB1Q16531 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
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