Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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SSX1Q16384 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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SSX1Q16384 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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SSX1Q16384 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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SSX1Q16384 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
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SSX1Q16384 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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SSX1Q16384 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSX1Q16384 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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