Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
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LAMA4Q16363 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
LAMA4Q16363 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
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