Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CNGA3Q16281 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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