Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EFNB3Q15768 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms