Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ALX1Q15699 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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