Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIP10Q15642 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIP10Q15642 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms