Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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SF3A1Q15459 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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SF3A1Q15459 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
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SF3A1Q15459 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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SF3A1Q15459 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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SF3A1Q15459 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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SF3A1Q15459 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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SF3A1Q15459 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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SF3A1Q15459 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3A1Q15459 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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