Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
RYR3Q15413 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RYR3Q15413 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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