Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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PTPAQ15257 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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PTPAQ15257 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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PTPAQ15257 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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PTPAQ15257 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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PTPAQ15257 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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PTPAQ15257 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPAQ15257 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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