Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERPUD1Q15011 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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