Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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COL19A1Q14993 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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COL19A1Q14993 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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COL19A1Q14993 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
COL19A1Q14993 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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COL19A1Q14993 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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COL19A1Q14993 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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COL19A1Q14993 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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COL19A1Q14993 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL19A1Q14993 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL19A1Q14993 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL19A1Q14993 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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COL19A1Q14993 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL19A1Q14993 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL19A1Q14993 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL19A1Q14993 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COL19A1Q14993 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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