Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRCAPQ14761 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms